Zegras é Professor de Mobilidade e Planejamento Urbano e atual Chefe do Departamento da DUSP. Leciona métodos e técnicas de planejamento, planejamento integrado de uso do solo e transporte, métodos quantitativos e financiamento de transportes. Também ministrou aulas de planejamento e design urbano em Pequim, Boston, Cartagena (Colômbia), Guadalajara (México), Cidade do México e Santiago do Chile. Por mais de 10 anos, atuou no Conselho Executivo do Centro de Excelência BRT+ e no Comitê Científico Internacional do Centro de Desenvolvimento Urbano Sustentável ( CEDEUS ). De 2015 a 2020, foi o Investigador Principal do grupo de pesquisa interdisciplinar Future Urban Mobility , patrocinado pela Singapore MIT Alliance for Research and Technology . De 2007 a 2016, foi Líder da Área de Foco em Sistemas de Transporte do Programa MIT Portugal.